Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rprd1bQ9CSU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rprd1bQ9CSU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rprd1bQ9CSU0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms