Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspo2Q9CRZ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tspo2Q9CRZ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms