Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NmbQ9CR53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NmbQ9CR53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms