Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg12Q9CQY1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg12Q9CQY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms