Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rer1Q9CQU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rer1Q9CQU3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms