Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl35Q9CQL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl35Q9CQL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms