Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufa3Q9CQ91 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa3Q9CQ91 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms