Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpa3Q9CQ71 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpa3Q9CQ71 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms