Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Chmp3Q9CQ10 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chmp3Q9CQ10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp3Q9CQ10 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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