Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim26Q99PN3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim26Q99PN3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim26Q99PN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms