Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cntnap4Q99P47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap4Q99P47 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms