Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a6dQ99N07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a6dQ99N07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms