Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KarsQ99MN1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KarsQ99MN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KarsQ99MN1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KarsQ99MN1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms