Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nme5Q99MH5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nme5Q99MH5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nme5Q99MH5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme5Q99MH5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nme5Q99MH5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms