Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gins4Q99LZ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms