Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmp1Q99KU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmp1Q99KU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms