Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lactb2Q99KR3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lactb2Q99KR3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lactb2Q99KR3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms