Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dok4Q99KE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dok4Q99KE3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dok4Q99KE3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms