Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmagpQ99KC7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmagpQ99KC7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmagpQ99KC7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms