Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Letmd1Q924L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Letmd1Q924L1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms