Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Csmd1Q923L3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csmd1Q923L3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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