Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b5Q923D4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3b5Q923D4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3b5Q923D4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms