Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim59Q922Y2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim59Q922Y2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim59Q922Y2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms