Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok1Q922Q2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Riok1Q922Q2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok1Q922Q2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms