Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FdpsQ920E5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FdpsQ920E5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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