Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Afg3l1Q920A7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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