Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin3bQ91ZU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin3bQ91ZU9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grin3bQ91ZU9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms