Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PccaQ91ZA3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PccaQ91ZA3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PccaQ91ZA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.7 ms