Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha5Q91Y15 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdha5Q91Y15 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha5Q91Y15 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms