Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM1

Strbp, Spermatid perinuclear RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrbpQ91WM1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StrbpQ91WM1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
StrbpQ91WM1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
StrbpQ91WM1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms