Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp3Q91W36 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp3Q91W36 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp3Q91W36 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms