Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pth2Q91W27 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pth2Q91W27 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms