Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mark1Q8VHJ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mark1Q8VHJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mark1Q8VHJ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mark1Q8VHJ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mark1Q8VHJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms