Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cul7Q8VE73 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cul7Q8VE73 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cul7Q8VE73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cul7Q8VE73 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms