Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc9Q8VC31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc9Q8VC31 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc9Q8VC31 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms