Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup35Q8R4R6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup35Q8R4R6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nup35Q8R4R6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms