Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c5Q8R2T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c5Q8R2T8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms