Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim29Q8R2Q0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim29Q8R2Q0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim29Q8R2Q0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim29Q8R2Q0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms