Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rdh16f2Q8K3M1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rdh16f2Q8K3M1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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