Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c1Q8K193 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34c1Q8K193 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms