Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbrd1Q8K0B2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbrd1Q8K0B2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms