Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc45Q8CIM1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc45Q8CIM1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc45Q8CIM1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms