Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt5Q8CIG8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt5Q8CIG8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt5Q8CIG8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt5Q8CIG8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt5Q8CIG8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prmt5Q8CIG8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt5Q8CIG8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms