Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopaQ8CIE6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopaQ8CIE6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms