Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam20aQ8CID3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20aQ8CID3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms