Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim32Q8CH72 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim32Q8CH72 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim32Q8CH72 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms