Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc73Q8CDM4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc73Q8CDM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms