Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo43Q8CDI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo43Q8CDI2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo43Q8CDI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms