Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms