Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin9Q8C735 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin9Q8C735 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin9Q8C735 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms